Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc46a3Q9DC26 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms