Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TrmuQ9DAT5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms