Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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