Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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