Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Utp23Q9CX11 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms