Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms