Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcl11bQ99PV8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms