Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms