Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp16Q99LG0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp16Q99LG0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp16Q99LG0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp16Q99LG0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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