Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hps4Q99KG7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hps4Q99KG7 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hps4Q99KG7 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hps4Q99KG7 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hps4Q99KG7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hps4Q99KG7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Hps4Q99KG7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Hps4Q99KG7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hps4Q99KG7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hps4Q99KG7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hps4Q99KG7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hps4Q99KG7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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