Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrabdQ99JY4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms