Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spef1Q99JL1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spef1Q99JL1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms