Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms