Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2afjQ8R1M2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms