Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ssh3Q8K330 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms