Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms