Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c1Q8K193 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms