Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn3Q8K045 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms