Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf628Q8CJ78 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms