Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm28Q8CGC6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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