Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vwc2Q8C8N3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms