Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp47Q8BY87 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp47Q8BY87 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms