Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ctdsp2Q8BX07 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms