Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtpaQ8BWP5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms