Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Atg4bQ8BGE6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4bQ8BGE6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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