Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms