Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms