Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms