Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Clec18aQ7TSQ1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Clec18aQ7TSQ1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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