Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc88cQ6VGS5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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