Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RgmaQ6PCX7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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