Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Atad3aos-204ENSMUST00000174185 482 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
NipblQ6KCD5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms