Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CltbQ6IRU5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms