Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krt40Q6IFX3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms