Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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