Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Defa17Q64016 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Defa17Q64016 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa17Q64016 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Defa17Q64016 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Defa17Q64016 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms