Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtmQ62388 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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