Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms