Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
TefmQ5SSK3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
TefmQ5SSK3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms