Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Skap2Q3UND0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms