Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp19Q3UJD6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp19Q3UJD6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp19Q3UJD6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp19Q3UJD6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp19Q3UJD6 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp19Q3UJD6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp19Q3UJD6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms