Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6348-201ENSMUST00000200751 1443 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6346-201ENSMUST00000201146 1443 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26800-201ENSMUST00000180871 349 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6555-201ENSMUST00000195167 789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtpbp6Q3U6U5 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms