Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srsf6Q3TWW8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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