Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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