Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hddc2Q3SXD3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms