Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm43511-201ENSMUST00000197084 2297 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccbe1Q3MI99 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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