Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rundc1Q0VDN7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms