Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Itgb8Q0VBD0 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Itgb8Q0VBD0 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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