Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Pate4Q09098 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Pate4Q09098 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms