Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cdx4Q07424 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms